Gilles Bouctot est ingénieur diplômé de l’École Centrale de Paris, et a commencé sa carrière à Snecma en 1983, où il a occupé successivement différents postes de contrôle financier et de gestion de la production.
Il a rejoint Aircelle (anciennement Hurel-Dubois) en 1999 en tant que Directeur Industriel avant sa nomination au poste de vice-président exécutif et chef de l’exploitation en 2000.
En 2004, Gilles Bouctot a été nommé président-directeur général de Messier Services International.
Il rejoint le siège du groupe Safran en 2008 comme adjoint au vice-président exécutif de la branche Équipements aéronautiques, en charge de la stratégie et des opérations.
En 2010, il est nommé Chief Operating Officer pour Messier-Dowty et CEO le 10 Janvier 2011.
En mai 2011 il devient directeur de la division Trains d’atterrissages et Intégration de Systèmes et Directeur Général Adjoint de Messier-Bugatti-Dowty.